Data Challenge 

 

Cette année est un moment important pour notre congrès et pour la Société Française de Pathologie : nous entrons de plain-pied dans la dimension I.A. !

L’I.A., ou Intelligence Artificielle, est une approche nouvelle pour notre discipline, même si on sait que les bases théoriques de l’I.A. remontent déjà à plusieurs décennies. Ce qui a changé, pour nous et pour tous les domaines de la vie impactés par l’I.A, ce sont les capacités de calcul des processeurs qui ont considérablement augmenté, et surtout notre capacité collective à accumuler des données dans des formats numériques. Pour l’Anatomie Pathologique, c’est évidemment le développement des lames virtuelles qui a tout bouleversé : même si l’espace de stockage reste une contrainte, le principe de numériser toute notre production quotidienne de lames est maintenant possible, et mis en place dans certains laboratoires. Un laboratoire qui avance vers le 100% numérique, au-delà de la fluidification de ses process et du partage facilité, va naturellement se poser la question de l’utilisation de cette numérisation pour faciliter le diagnostic. C’est là que devraient intervenir les algorithmes d’I.A. pour aider le pathologiste dans les tâches fastidieuses (décomptes, mesures), pour détecter des lésions mal visibles parmi de nombreuses lames, ou un jour pour nous suggérer tel ou tel diagnostic. Au-delà même de notre diagnostic, beaucoup espèrent que ces algorithmes qui scruteront nos lames y trouveront des informations invisibles pour nos yeux, pour par exemple prédire la réponse à un traitement.

Toutes ces promesses sont fascinantes, mais il faut encore nuancer, car la réalité actuelle est plutôt faite d’algorithmes mono-tâches et gérant mal la diversité de nos prélèvements et de nos techniques. Pour avancer sur cette voie d’avenir, la Société Française de Pathologie travaille depuis 6 mois sur son premier data challenge autour de lames virtuelles de lésions épithéliales du col utérin. Ce challenge va mettre en compétition des équipes qui devront développer l’algorithme dont l’analyse se rapprochera le plus de la “vérité de terrain” définie par un panel d’experts. Le recrutement de plus de 4000 lames est maintenant terminé et les annotations par un panel d’expert sont en cours.  La compétition elle même va démarrer le 7septembre 2020, avec un jeu de lames d’apprentissage et un jeu de lames de test, et les équipes entraîneront leurs algorithmes sur ces lames pendant deux mois. La phase finale se déroulera à Carrefour 2020, avec plusieurs moments forts : l’ouverture du dernier jeu de lames sur lequel les équipes et leurs algorithmes vont vraiment se confronter, la fermeture de la compétition deux jours plus tard, et la remise des 25k€ de prix le dernier jour du congrès. Le meilleur algorithme sera distingué mais aussi les deux meilleurs inclueurs de lames, afin que chaque contributeur pathologiste ou chaque compétiteur soit porté par la dynamique du challenge.

Nous vous donnons donc rendez-vous à Carrefour Pathologie 2020 en novembre pour suivre cet évènement innovant, et nous invitons aussi les compétiteurs potentiels à se signaler dès à présent sur la page de lancement du Data Challenge :

Enfin, pour celles et ceux qui voudraient participer à une équipe, mais qui cherchent des contacts, n’hésitez pas à écrire à la SFP (sfpathol@gmail.com) qui pourra vous aider à faire des rapprochements synergiques !